【内容】ポケモンBW2エンディング後、イッシュでの旅の終わりを迎えたトウヤ、トウコは冒険のため、そしてアララギ博士からの『メガシンカ』の謎の調査のため、次の舞台、ホウエン地方を目指し旅に出た。
二人はホウエン行きのロイヤルイッシュ号に乗り込む。そこでトウコは多くのトレーナーからバトルを申し込まれる。そんな時、ホウエンの元チャンピオン・ダイゴと、カントーの伝説・レッドが現れ…

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