地球連邦、ノイエDC、シャドウミラー、インスペクター、そしてアインストの五大勢力による混戦状態に陥っていた地球圏。だが、突如としてアインストが各勢力に一斉攻撃を仕掛けたことで事態が動き出す。
ハガネ＆ヒリュウ改は、この混乱に乗じて各勢力の各個撃破を狙い、最初の目標をアフリカ大陸・アースクレイドルに陣取るノイエDCに定める。アインストを撃滅すべく復活した超機人、仲間の絆で過去を振り払ったSRXチームとブーステッドチルドレンのゼオラ、そしてアインストの手に落ちたエクセレンを救うべく、キョウスケの新たなる“切り札”……アルトアイゼン・リーゼが戦場へと降り立つ。彼らはいかなる戦いぶりで難局を切り抜けるのか？