さすがにあれはコーヒーフィルターか何かで濾し取らない限り、取るのは無理な気がします。
火鳥さんの漫画では、専用の便利な道具が紹介されてました。

Of course, I get the feeling that collecting it would've been impossible unless I'd strained my pee through a coffee filter or something.

A "conveniently specialized instrument":[/posts/2321580] for this was introduced in one of "Hitori-san's":[/artists/21195] manga.